Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC8Q8TC99 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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