Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL4L1Q8NHW4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL4L1Q8NHW4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms