Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms