Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
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