Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLIP4Q8N3C7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLIP4Q8N3C7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLIP4Q8N3C7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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