Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms