Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC6Q8IVU3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms