Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms