Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDZD4Q76G19 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDZD4Q76G19 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms