Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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LINC00299Q6ZSB3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00299Q6ZSB3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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