Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms