Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27BQ5VT28 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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