Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms