Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF628Q5EBL2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms