Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSP90AA4PQ58FG1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms