Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms