Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLEKHN1Q494U1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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