Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms