Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROX2Q3B8N5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms