Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms