Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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