Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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