Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms