Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHQ16836 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHQ16836 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHQ16836 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHQ16836 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHQ16836 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHQ16836 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHQ16836 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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