Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCK2Q16822 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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