Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms