Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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HIF1AQ16665 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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