Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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