Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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