Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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VAMP3Q15836 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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VAMP3Q15836 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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VAMP3Q15836 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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