Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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