Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms