Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms