Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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SEC23BQ15437 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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