Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPRRQ15256 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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