Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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