Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms