Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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