Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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