Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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