Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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