Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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