Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDAP1Q13442 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms