Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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