Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms