Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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