Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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MRPL28Q13084 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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MRPL28Q13084 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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