Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms