Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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