Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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